Une stratégie de mise en commun moins coûteuse et rapide pour la détection du SRAS-CoV-2 basée sur la RT-PCR

Dans un rapport dans le Journal of Molecular Diagnostics, publié par Elsevier, des chercheurs de l'Université d'Augusta et de PerkinElmer Genomics décrivent une stratégie de mise en commun moins chère, rapide et précise pour la détection par RT-PCR du SRAS-CoV-2 dans des échantillons cliniques.

Ce test a un impact significatif sur le dépistage à grande échelle de la population à la suite de la pandémie actuelle de COVID-19.

La pandémie COVID-19 a provoqué une pression massive sur les systèmes de santé, la gouvernance et les économies mondiaux. Les tests de dépistage du SRAS-CoV-2 ont pris du retard dans de nombreux pays en raison de divers goulots d'étranglement, y compris, mais sans s'y limiter, la défaillance de la chaîne d'approvisionnement en réactifs, le manque de kits de test adéquats et des obstacles dans les processus analytiques et réglementaires.

Nous avons proposé une approche de dépistage de masse de la population basée sur une stratégie de mise en commun d'échantillons pour un dépistage rapide et à grande échelle de la population qui pourrait être adoptée par les laboratoires utilisant actuellement des méthodes basées sur la RT-PCR pour tester le SRAS-CoV-2. « 

Ravindra Kolhe, MD, PhD, vice-présidente de la recherche translationnelle, Département de pathologie, Medical College of Georgia, Augusta University

Selon le Dr Kolhe, cette stratégie entraînerait une réduction d'environ 5 à 10 fois le coût des tests du SRAS-CoV-2. Le kit RT-PCR FDA-EUA (Emergency Use Authorization) de PerkinElmer pour la détection du SARS-CoV-2 (avec une limite de détection de 5 à 20 copies / ml) est mis en œuvre en laboratoire par le Dr Kolhe depuis mars 2020.

Les enquêteurs ont analysé environ 1 000 échantillons en utilisant cette approche d'échantillonnage groupé et ont obtenu 91,6% de PPA (pourcentage de concordance positif) et 100% de NPA (pourcentage de concordance négatif) par rapport à l'approche de dépistage de routine.

L'étude démontre l'utilité clinique et la précision de la stratégie de regroupement d'échantillons et présente une disposition soigneusement planifiée pour les tests de population de masse qui peuvent être exécutés par des laboratoires utilisant des méthodes basées sur la RT-PCR pour détecter le SRAS-CoV-2.

La méthodologie proposée a le potentiel de permettre aux établissements d'augmenter leurs besoins en tests de manière rentable avec des délais d'exécution minimaux.

Ces tests permettent l'isolement et le traitement en temps opportun des patients positifs au COVID-19, en particulier dans les populations présentant une prévalence plus faible de la maladie, par exemple, le dépistage d'un grand nombre d'étudiants retournant sur les campus universitaires.

«En termes d'analyse des coûts, un million d'individus peuvent être testés pour environ 9,1 millions de dollars américains avec l'approche de dépistage de masse proposée dans la population, contre environ 58 millions de dollars américains avec les méthodes de diagnostic de routine actuelles.

Ces projections de coûts mettent en évidence des économies importantes en dollars de la santé qui pourraient être réalisées dans les pays à revenu élevé et faible / intermédiaire », a déclaré Amyn Rojiani, MD, PhD, directeur du département de pathologie, Augusta University, Augusta, GA, États-Unis.

L'impact mondial de ces énormes économies a le potentiel d'améliorer les opérations des laboratoires tout au long de la pandémie et peut être déployé dans des laboratoires confrontés à de graves contraintes d'approvisionnement.

La source:

Référence du journal:

Sahajpal, N. S., et al. (2020) Proposition de dépistage de masse de population basé sur la transcription inverse-PCR pour le SRAS-CoV-2 (COVID-19). Journal of Molecular Diagnostics. doi.org/10.1016/j.jmoldx.2020.07.001.

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