Xanthomonas euroxanthea, une nouvelle espèce de bactérie isolée à partir de noix malade découverte au Portugal. Bactéries récemment isolées de la noix (Juglans regia L.) au Portugal a été identifié comme une nouvelle espèce de Xanthomonas.
Fait intéressant, cette nouvelle espèce baptisée Xanthomonas euroxanthea comprend à la fois des souches pathogènes et non pathogènes sur le noyer, constituant un modèle unique pour faire face à l'émergence et à l'évolution de la pathogénicité chez Xanthomonas.
Cette découverte résulte d'une collaboration internationale dans le cadre de la coopération européenne en science et technologie, COST Action EuroXanth.
La preuve scientifique qui valide cette nouvelle espèce, X. euroxanthea, a été publié dans l'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.
Le travail qui a conduit à cette découverte a été une collaboration entre le groupe du Dr Fernando Tavares du Centre de Recherche en Biodiversité et Ressources Génétiques et le Laboratoire Associé InBIO (CIBIO-InBIO) situé à Porto, Portugal, et le Dr Joël F. Pothier de l'Environmental Genomics and Groupe de recherche en biologie des systèmes de l'Université des sciences appliquées de Zurich (ZHAW) en Suisse.
Cette étude a bénéficié d'une mission scientifique à court terme de COST Action EuroXanth pour développer ce travail, d'où le nom « X. euroxanthea« .
La nouvelle espèce, X. euroxanthea a été trouvé lors d'une enquête qui a révélé une grande diversité génétique des bactéries associées à la noix X. arboricola pv. juglandis dans différentes régions bioclimatiques du Portugal et même au sein d'un seul noyer.
En fait, des lignées de xanthomonades pathogènes et non pathogènes ont été trouvées co-colonisant un seul noyer, suggérant un mode de vie sympatrique qui pourrait contribuer à dévoiler des compromis génétiques liés à la pathogénicité de Xanthomonas. C'était la première fois qu'un non-Xanthomonas arboricola Il est prouvé que l'espèce cause des maladies chez le noyer.
Ces résultats sont très prometteurs, car désormais la communauté scientifique dispose d'un modèle unique pour évaluer l'émergence de l'évolution de la pathogénicité ainsi que la co-évolution des bactéries qui partagent le noyer a un hôte.
La prochaine étape consistera à étudier les gènes clés impliqués dans la pathogénicité et la virulence chez cette nouvelle espèce visant à développer des marqueurs de détection pour la détection des souches pathogènes à travers des enquêtes phytosanitaires pour définir des plans de contrôle épidémiologique efficaces. L'analyse génomique a révélé des différences significatives sur les profils de la pathogénicité et des gènes de virulence, qui peuvent être déterminantes pour expliquer des modes de vie distincts et des comportements infectieux. «
Dr Fernando Tavares, professeur, Faculté des sciences, Université de Porto
Tavares est également chercheur à CIBIO-InBIO.
Le Dr Joël F. Pothier a déclaré: «Les travaux menés par les deux institutions de recherche sont un parfait exemple de la mission de COST: offrir des opportunités de réseautage pour faciliter la coopération en science et technologie.
En outre, le travail de collaboration entre les chercheurs de trois pays participant à cette action a été favorisé par une mission scientifique à court terme d'une chercheuse en début de carrière, Camila Fernandes, d'un pays ciblé sur l'inclusivité.
Ce sont exactement parmi les valeurs prioritaires que COST promeut. Nous sommes donc très fiers, comme l'a également noté le président de l'Action, le Dr Ralf Koebnik, que notre travail ait rendu notre Action immortelle en nommant la bactérie après elle! «
Noyer commun (Juglans regia) est une culture arboricole économiquement importante dans le monde, étant la principale espèce cultivée pour les fruits de noix et la production de bois.
Actuellement, la base de données mondiale sur la protection des végétaux en Europe et en Méditerranée (OEPP) répertorie X. arboricola pv. juglandis comme causant une maladie bactérienne majeure affectant cet hôte dans toutes les principales régions de production de noix, provoquant des symptômes tels que des taches nécrotiques sur les feuilles et les fruits, une chute prématurée des fruits et une nécrose de l'embryon à l'intérieur du fruit entraînant d'énormes pertes de production et une chute économique.
Ce nouveau pathogène de la noix constitue une autre menace pour la production de noix.
La source:
Coopération européenne en science et technologie
Référence du journal:
Martins, L., et al. (2020) Xanthomonas euroxanthea sp. nov., une nouvelle espèce de xanthomonade comprenant des souches pathogènes et non pathogènes de noix en libre accès. Revue internationale de microbiologie systématique et évolutive. doi.org/10.1099/ijsem.0.004386.