Une étude environnementale récente du Royaume-Uni, actuellement disponible sur le bioRxiv * preprint server, montre que certaines surfaces communes pourraient représenter un risque infectieux si elles étaient contaminées par des concentrations élevées du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) – bien que le niveau de particules virales viables soit probablement faible.
La pandémie mondiale de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le SRAS-CoV-2, a été un succès en raison de la transmission virale par un certain nombre de voies différentes, y compris le contact humain avec des surfaces contaminées. Les personnes sont généralement contaminées soit à la suite de gouttelettes contenant le virus, soit au toucher.
Par conséquent, de nombreux chercheurs ont utilisé des approches analytiques moléculaires pour détecter le matériel génétique du SRAS-CoV-2 sur diverses surfaces; cependant, un virus viable a rarement été trouvé. Cela signifie que le risque d’infection par des surfaces contaminées par le virus est plutôt difficile à prédire, ce qui fait appel à d’autres études pour améliorer notre compréhension de sa capacité de survie.
Ce nouvel article de chercheurs britanniques (dirigé par le Dr Susan Elizabeth Paton du Public Health England, National Infection Service in Wiltshire) visait à évaluer la viabilité du SRAS-CoV-2 sur une certaine période après avoir été séché sur une gamme de matériaux, mais aussi pour comparer la viabilité du virus aux copies d’ARN récupérées et observer sa dépendance potentielle à la concentration.
Quantités moyennes de virus viables récupérés (pfu / coupon, orange) et d’ARN viral détecté (numéro de copie du génome / coupon, bleu), pour 7 matériaux évalués. Les barres d’erreur représentent l’écart type de trois répliques. La ligne en pointillé grise représente la limite de détection du test de plaque pour les dosages combinés des coupons en triple (0,8 pfu / ml). Pour la combinaison Tyvek et la blouse jetable, les coupons de 21 jours n’ont pas été traités.
Sommaire
Inoculer des matériaux courants
Dans cette étude, les chercheurs ont décidé d’utiliser des surfaces représentatives des sites de contact non poreux (comme l’acier inoxydable) et des billets de banque (c’est-à-dire des billets en polymère anglais de 10 GBP) et des équipements de protection individuelle qui sont omniprésents dans le milieu de la santé et l’environnement plus large, comme les masques chirurgicaux en couches, les blouses en plastique jetables et les combinaisons. Cela a été complété par des matériaux qui représentaient des articles vestimentaires, tels que des chemises de sport en polyester et des T-shirts en coton. Des coupons de 1 x 1 cm de chaque matériau ont été préparés.
La souche SARS-CoV-2 a été initialement isolée en utilisant des cellules Vero E6 (dérivées du rein d’un singe vert africain), et des aliquotes virales ont été décongelées à température ambiante immédiatement avant l’inoculation des matériaux. Le virus a été récupéré à partir des coupons, et un test de plaque a ensuite été réalisé. L’extraction d’ARN et l’analyse par réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse (RT-PCR) ont également été poursuivies.
En ce qui concerne l’analyse des données, chaque point dans le temps pour chaque coupon de matériel utilisé avait trois répliques biologiques (c’est-à-dire, des coupons individuels) et deux répliques techniques (c’est-à-dire, un test de plaque réalisé en double).
Stabilité optimale sur les surfaces hydrophobes non poreuses
Cette étude a démontré que l’isolat britannique SARS-CoV-2 pouvait rester viable sur des surfaces hydrophobes jusqu’à sept jours. Sa viabilité récupérable sur des surfaces hydrophiles est fondamentalement réduite à trois jours à température ambiante d’humidité relative.
Plus précisément, le virus viable a persisté le plus longtemps sur l’acier inoxydable et le matériau des masques chirurgicaux (plus de 100 heures pour une réduction de 99,9% de la viabilité du SRAS-CoV-2 pour les deux matériaux), tandis que la chute la plus rapide a été observée sur une chemise en polyester (réduction de 99,9% en 2,5 heures), suivi du coton (99,9% de réduction en 72 heures).
Dans tous les cas, le SRAS-CoV-2 était le plus stable sur les surfaces hydrophobes non poreuses, et l’ARN viral était très stable lorsqu’il était séché sur les surfaces – avec seulement une réduction logarithmique de la récupération sur trois semaines. Pourtant, il a été montré que la viabilité du SRAS-CoV-2 diminuait beaucoup plus rapidement, et un tel taux de désintégration était indépendant de la concentration de départ.
Matériel génétique vs virus viable
L’étude conclut que les niveaux attendus de contamination de surface de l’environnement viable par le SRAS-CoV-2 conduisent à des niveaux indétectables dans les deux jours. En d’autres termes, lorsque du matériel génétique viral (ARN) est détecté sur des surfaces, cela ne suggère pas directement la présence d’un virus viable.
« Cela a des implications pour l’interprétation des résultats d’échantillonnage de surface en utilisant la RT-PCR pour déterminer la possibilité d’un virus viable à partir d’une surface », mettent en garde les auteurs de l’étude dans ce bioRxiv papier. «À moins d’être échantillonnés immédiatement après la contamination, il est difficile d’aligner le nombre de copies d’ARN sur la quantité de virus viable sur une surface», ajoutent-ils.
Des études futures pourraient aborder cette limitation actuelle, où le nombre de copies est obtenu pour des concentrations beaucoup plus faibles de SRAS-CoV-2 présentes sur les surfaces. Par conséquent, cela aidera à déterminer si la persistance de l’ARN est indépendante de la concentration virale et élucide la relation exacte avec la récupération du virus viable.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
Référence du journal:
Paton, SE et coll. (2021). Persistance du virus SRAS-CoV-2 et de l’ARN viral sur les surfaces hydrophobes et hydrophiles et étude de la concentration de contamination. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.03.11.435056, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.03.11.435056v1