En utilisant les données des enquêtes épidémiologiques et des efforts de recherche des contacts pendant la phase initiale de l’épidémie de maladie à coronavirus (COVID-19) en France, les chercheurs ont pu évaluer les taux d’attaque clinique secondaire et les facteurs associés au risque qu’un contact devienne un cas. Leurs résultats sont actuellement disponibles dans un medRxiv * papier de pré-impression.
Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), un agent causal de la pandémie de COVID-19, s’est propagé rapidement à travers le monde depuis son apparition à Wuhan, en Chine. La raison principale est sa propagation rapide d’une personne à l’autre par la voie respiratoire.
Au début de l’épidémie, la France a fait un effort substantiel pour contenir l’importation du virus sur son territoire. En janvier 2020, un système de surveillance inébranlable a déjà été mis en place dans tout le pays, ce qui a permis la détection précoce des cas et des contacts, mais a également ralenti la propagation du virus et arrêté les événements de transmission secondaires.
Une telle recherche des contacts représente un outil indispensable pour contrôler les épidémies et s’est avérée efficace par le passé. Cependant, son utilisation peut également améliorer les connaissances sur l’histoire naturelle des agents pathogènes émergents (comme le SRAS-CoV-2) et leur dynamique de transmission.
Par conséquent, un groupe de chercheurs français, dirigé par le Dr Paireau Juliette de l’Institut Pasteur à Paris, avait pour objectif d’évaluer les taux d’attaque clinique secondaire et d’identifier les facteurs de risque qui jouent un rôle dans la transformation des contacts en cas, mais aussi d’estimer les chaînes de transmission et paramètres clés de la propagation virale.
Chaînes de transmission. (A) Chaînes de transmission observées. Seuls les cas confirmés / contacts impliqués dans une chaîne avec au moins un cas confirmé sont représentés. (B) Répartition du sexe. (C) Répartition de l’âge.
Sommaire
Utiliser le système de surveillance rigoureux
Dans cette étude, les chercheurs ont analysé des données détaillées recueillies lors d’enquêtes rétrospectives d’épidémie et de recherche des contacts dans la phase précoce de l’épidémie en France – plus précisément, du 24 janvier 2020 au 30 mars 2020, deux semaines après le verrouillage.
Les données ont été utilisées pour évaluer en détail les taux d’attaques cliniques secondaires et caractériser le risque que le contact devienne un cas parmi 6 082 contacts sur 735 cas index. En outre, des chaînes de transmission ont été décrites, avec l’estimation subséquente des paramètres clés de la propagation parmi 328 paires infectés / infectés.
Les protocoles et les définitions de cas ont évolué au cours de la période d’étude afin de s’adapter à l’évolution de la situation épidémique tandis que de nouvelles connaissances sur le SRAS-CoV-2 et sa transmission ont émergé. Après la collecte, toutes les données ont été saisies dans une application Web sécurisée.
Dévoiler l’importance des super-épandeurs
Cette étude a révélé un taux global d’attaque clinique secondaire de 4,1%, qui augmentait significativement avec l’âge du cas index et du contact. Les contacts familiaux couraient un risque beaucoup plus élevé de devenir des cas, alors que les contacts à l’hôpital étaient moins à risque que les collègues ou amis.
De plus, la distribution des cas secondaires était très surdispersée, 80% des cas secondaires étant dus à seulement 10% des cas. L’intervalle en série moyen était de 5,1 jours dans les paires de recherche des contacts, ce qui correspond aux estimations publiées de 4 à 6 jours obtenues dans des contextes similaires d’isolement des cas.
Enfin, le nombre moyen de cas secondaires associés à chaque cas index était de 0,3 à 0,9. Ces valeurs sont inférieures aux estimations du nombre de reproduction du SRAS-CoV-2 en l’absence d’interventions ou d’immunité de la population, qui se situe généralement entre 2,5 et 3.
Des leçons précieuses pour les épidémiologistes
Cette étude contribue certainement à affiner nos connaissances sur la transmission du SRAS-CoV-2, en particulier compte tenu de l’importance des événements de sur-propagation avec toutes les implications qui l’accompagnent pour les efforts de lutte.
«Dans notre population d’étude, nous avons constaté que le risque de devenir un cas était plus de deux fois plus élevé pour les contacts âgés de plus de 45 ans par rapport aux 15-29 ans», soulignent les auteurs de l’étude dans ce medRxiv papier.
« Il est intéressant de noter que les profils de contact par âge observés dans notre étude avant l’isolement des cas étaient très cohérents avec ceux obtenus lors d’une enquête démographique à grande échelle menée en France en 2012 », ajoutent-ils.
Malgré les efforts colossaux nécessaires pour effectuer la recherche des contacts pendant les épidémies, la collecte et l’analyse appropriées de ce type de données sont essentielles pour améliorer la compréhension de la transmission de la maladie et adapter des stratégies de contrôle hautement efficaces.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.