Les chercheurs ont mis au point un test ADN pour identifier rapidement les infections secondaires chez les patients COVID-19, qui ont deux fois plus de risque de développer une pneumonie pendant la ventilation que les patients non COVID-19.
Pour les patients atteints des formes les plus sévères de COVID-19, la ventilation mécanique est souvent le seul moyen de les maintenir en vie, car les médecins utilisent des thérapies anti-inflammatoires pour traiter leurs poumons enflammés. Cependant, ces patients sont susceptibles de contracter d’autres infections par des bactéries et des champignons qu’ils peuvent contracter pendant leur séjour à l’hôpital – ce qu’on appelle la «pneumonie associée au ventilateur».
Maintenant, une équipe de scientifiques et de médecins de l’Université de Cambridge et des hôpitaux universitaires de Cambridge NHS Foundation Trust, dirigée par le professeur Gordon Dougan, le Dr Vilas Navapurkar et le Dr Andrew Conway Morris, a développé un test ADN simple pour identifier rapidement ces infections et cibler traitement antibiotique au besoin.
Le test, développé à l’hôpital d’Addenbrooke en collaboration avec Public Health England, donne aux médecins les informations dont ils ont besoin pour commencer le traitement en quelques heures plutôt qu’en quelques jours, en ajustant le traitement au besoin et en réduisant l’utilisation inappropriée d’antibiotiques.
Cette approche, basée sur des tests ADN à plus haut débit, est en cours de déploiement dans les hôpitaux universitaires de Cambridge et offre une voie vers de meilleurs traitements pour l’infection en général. Les résultats sont rapportés dans le journal Soin critique.
Les patients qui ont besoin d’une ventilation mécanique courent un risque important de développer une pneumonie secondaire pendant qu’ils sont en soins intensifs. Ces infections sont souvent causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques, sont difficiles à diagnostiquer et nécessitent un traitement ciblé.
Au début de la pandémie, nous avons remarqué que les patients atteints de COVID-19 semblaient particulièrement à risque de développer une pneumonie secondaire, et avons commencé à utiliser un test de diagnostic rapide que nous avions développé pour une telle situation. En utilisant ce test, nous avons constaté que les patients atteints de COVID-19 étaient deux fois plus susceptibles de développer une pneumonie secondaire que les autres patients de la même unité de soins intensifs. «
Dr Andrew Conway Morris, co-auteur de l’étude et et consultant en soins intensifs, Département de médecine, Université de Cambridge
On pense que les patients atteints de COVID-19 présentent un risque accru d’infection pour plusieurs raisons. En raison de l’ampleur des lésions pulmonaires, ces cas graves de COVID-19 ont tendance à passer plus de temps sur un ventilateur que les patients sans COVID-19.
En outre, nombre de ces patients ont également un système immunitaire mal régulé, où les cellules immunitaires endommagent les organes, mais ont également des fonctions antimicrobiennes altérées, augmentant le risque d’infection.
Normalement, la confirmation d’un diagnostic de pneumonie est difficile, car les échantillons bactériens de patients doivent être cultivés et cultivés dans un laboratoire, ce qui prend du temps. Le test de Cambridge adopte une approche alternative en détectant l’ADN de différents agents pathogènes, ce qui permet des tests plus rapides et plus précis.
Le test utilise une réaction en chaîne par polymérase multiple (PCR) qui détecte l’ADN de la bactérie et peut être effectué en environ quatre heures, ce qui signifie qu’il n’est pas nécessaire d’attendre que la bactérie se développe. « Souvent, les patients ont déjà commencé à recevoir des antobiotiques avant que les bactéries n’aient eu le temps de se développer en laboratoire », a déclaré Morris.
« Cela signifie que les résultats des cultures sont souvent négatifs, alors que la PCR n’a pas besoin de bactéries viables pour être détectée – ce qui en fait un test plus précis. »
Le test – qui a été développé avec le Dr Martin Curran, spécialiste des diagnostics PCR du laboratoire de Cambridge de Public Health England – exécute plusieurs réactions PCR en parallèle et peut détecter simultanément 52 agents pathogènes différents, qui infectent souvent les poumons des patients en soins intensifs. En même temps, il peut également tester la résistance aux antibiotiques.
«Nous avons constaté que bien que les patients atteints de COVID-19 étaient plus susceptibles de développer une pneumonie secondaire, les bactéries à l’origine de ces infections étaient similaires à celles des patients en soins intensifs sans COVID-19», a déclaré l’auteur principal Mailis Maes, également du Département de médecine. « Cela signifie que les protocoles antibiotiques standard peuvent être appliqués aux patients COVID-19. »
C’est l’une des premières fois que cette technologie est utilisée dans la pratique clinique de routine et a maintenant été approuvée par l’hôpital. Les chercheurs prévoient que des approches similaires bénéficieraient aux patients si elles étaient utilisées plus largement.
La source:
Référence du journal:
Maes, M., et al. (2021) Pneumonie associée à un ventilateur chez les patients gravement malades atteints de COVID-19. Soin critique. doi.org/10.1186/s13054-021-03460-5.