Des chercheurs du Trinity College de Dublin ont fourni une estimation mise à jour de la période d'incubation du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) – l'agent provoque la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Les estimations initiales faites pendant les premiers stades de la pandémie allaient de 4 à 7 jours environ.
Cependant, de nombreux rapports sont apparus depuis, estimant une période d'incubation de un à 34 jours.
Actuellement, les gouvernements planifient leurs stratégies d'atténuation sur la base d'une période d'incubation maximale de 14 jours.
Maintenant, Prakashini Banka et Catherine Comiskey ont mené une étude de modélisation mettant en évidence la variabilité de cette période, y compris le potentiel d'incubation qui s'étend au-delà de 14 jours.
Une estimation précise de la distribution de la période d'incubation du SRAS-CoV-2 est essentielle pour modéliser la propagation du virus et l'efficacité des mesures de contrôle.
Banka et Comiskey avertissent que la période d'incubation pouvant être plus longue que ce qui avait été initialement estimé, une surveillance détaillée des périodes d'auto-isolement et d'autres mesures de protection est désormais nécessaire.
Une version pré-imprimée du papier est disponible sur le serveur medRxiv *, tandis que l'article fait l'objet d'un examen par les pairs.
Cette image au microscope électronique à balayage montre le SRAS-CoV-2 (jaune) – également connu sous le nom de 2019-nCoV, le virus qui cause le COVID-19 – isolé d'un patient aux États-Unis, émergeant de la surface de cellules (rose) cultivées dans le laboratoire. Image capturée et colorisée aux Rocky Mountain Laboratories (RML) du NIAID à Hamilton, Montana. Crédit: NIAID
Les défis rencontrés dans la modélisation de la propagation du SRAS-CoV-2
Les premières estimations de la période d'incubation du SRAS-CoV-2 allaient de 4,0 à 6,4 jours, mais depuis lors, plusieurs études ont estimé que les périodes d'incubation varient de un à 34 jours.
Lorsqu'une épidémie entraîne des infections à la fois symptomatiques et asymptomatiques, il devient difficile d'établir la prévalence et la transmission de la maladie.
«La modélisation mathématique du nombre effectif de reproduction R d'une épidémie, la propagation de l'infection et les décisions ultérieures sur la planification et l'atténuation dépendent entièrement d'estimations précises et à jour des principaux paramètres de modélisation», affirment les chercheurs.
Compte tenu des améliorations de la surveillance et du suivi depuis l'identification des premiers cas, Banka et Comiskey ont maintenant mené un examen de la portée et une méta-analyse des paramètres de la période d'incubation mondiale du COVID-19.
Le but était de fournir une estimation actualisée de la distribution de la période d'incubation qui aidera à améliorer les estimations de modélisation du nombre effectif de reproduction R et, par conséquent, les estimations de la prévalence des cas asymptomatiques.
Qu'ont fait les chercheurs?
L'équipe a effectué des recherches dans cinq bases de données, dont CINAHL, MEDLINE, PUBMED, EMBASE, ASSIA et Global Index Medicus, pour des études publiées entre le 1er janvier 2020 et le 27 juillet 2020.
Après avoir examiné les articles, 64 ont été inclus, couvrant un total de 45 151 personnes âgées de 0 à 90 ans, avec un âge médian de 43 ans.
La période d'incubation minimale variait de 1 à 9 jours et la période d'incubation maximale variait de 4 à 34 jours. La période d'incubation moyenne (basée sur 30 études) était de 6,71, avec des intervalles de confiance à 95% allant de 1 à 12,4 jours.
Un intervalle de confiance (IC) est une estimation qui indique la plage de valeurs dans laquelle la valeur réelle pourrait se trouver. Par conséquent, l'IC aide à quantifier l'incertitude d'une estimation lorsque la valeur réelle ne peut être connue.
La période d'incubation médiane (basée sur 58 études) était de 6 jours, avec un intervalle interquartile (IQR) de 1,8 à 16,3.
L'IQR est une mesure de l'endroit où se trouvent les 50% du milieu des valeurs dans un ensemble de données, indiquant où se trouvent la plupart des valeurs. Plus le IQR est petit, plus les données sont proches de la médiane, tandis que plus le IQR est grand, plus les données sont écartées de la médiane.
Banka et Comiskey affirment que cette étude a révélé que la période d'incubation moyenne peut être beaucoup plus longue que ce qui avait été précédemment estimé.
«Les résultats mettent en évidence la variabilité de la période moyenne et le potentiel d'incubation supplémentaire au-delà de 14 jours», écrivent-ils.
Il est essentiel de maintenir une estimation précise et à jour
Les chercheurs disent qu'il est essentiel de maintenir une estimation précise et à jour de la période d'incubation du SRAS-CoV-2 alors que le virus continue de se propager afin que les mesures d'atténuation et les conseils au grand public puissent être correctement planifiés.
«Il est tout aussi essentiel que les stratégies d'atténuation sur les communautés affectées et les exigences de planification hospitalière déterminées à partir de scénarios de modélisation soient basées sur des estimations mondiales fiables et précises de la période d'incubation», ajoutent-ils.
«Il existe un besoin permanent de surveillance détaillée du moment des périodes d'auto-isolement et des mesures connexes protégeant les communautés, car les périodes d'incubation peuvent être plus longues», conclut l'équipe.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
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