Les chauves-souris sont connues depuis longtemps comme des hôtes importants d’agents pathogènes viraux zoonotiques. Les virus zoonotiques transmis par les chauves-souris sont capables d’infecter les humains et ont causé des infections dévastatrices dans le monde entier. Les virus zoonotiques courants comprennent le virus Ebola et les coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Bien que les rétrovirus soient connus pour avoir un impact mondial majeur sur la santé humaine, le potentiel zoonotique des rétrovirus des chauves-souris est actuellement inconnu.
Étude : Rétrovirus de chauves-souris : une menace qui attend dans les ailes ?. Crédit d’image : Rob D le boulanger/Shutterstock
Les rétrovirus appartiennent à la famille Rétroviridies qui comprend le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le virus lymphotrope T humain (HTLV). Les deux sont des virus zoonotiques qui se sont propagés aux humains à partir de primates non humains.
La connaissance des rétrovirus de chauve-souris s’est développée au cours des deux dernières décennies en raison de la découverte de séquences rétrovirales dans le génome de la chauve-souris. Ces séquences sont présentes en raison des caractéristiques clés du cycle de réplication rétrovirale qui comprend la synthèse d’ADN complémentaire (ADNc) et son intégration dans le génome de l’hôte, donnant naissance à un provirus. Ces provirus se fixent parfois sur le pool génétique de l’espèce hôte, donnant naissance à un rétrovirus endogène (ERV). Les VRE finissent par accumuler des mutations, deviennent fragmentées, défectueuses et incapables de produire des protéines virales. Ainsi, ces ERV agissent comme des fossiles génomiques qui aident à fournir l’histoire des infections rétrovirales chez les animaux et les humains et les rétrovirus exogènes actuellement circulants (XRV).
La pandémie de COVID-19 a fourni un nouveau stimulus pour identifier les menaces virales potentielles provoquées à l’avenir par les chauves-souris. Cette étude publiée dans les revues ASM examine comment les chauves-souris ont été affectées par les rétrovirus et les rétrovirus exogènes actuels circulant chez les chauves-souris. Elle permet également de déterminer si les séquences rétrovirales trouvées chez l’hôte appartiennent aux virus endogènes ou exogènes. De plus, la capacité des chauves-souris à recevoir et à transmettre des rétrovirus d’autres espèces est également examinée, ainsi que la question de savoir si les virus exogènes chez les chauves-souris constitueront une menace pour l’homme.
Sommaire
Étude rétrospective des rétrovirus de chauve-souris
La première association entre les chauves-souris et les rétrovirus a été étudiée dans des lignées cellulaires provenant du tissu pulmonaire de la chauve-souris brésilienne à queue libre, ce qui suggère que les cellules de chauve-souris sont sensibles à l’infection rétrovirale de diverses espèces de mammifères.
Des méthodes indépendantes de la culture telles que les technologies de séquençage à haut débit (HTS) et la PCR ont été utilisées pour découvrir ces rétrovirus. Le premier rapport de séquence rétrovirale chez les chauves-souris a été publié en 2004 et décrit la présence d’un VRE du genre Betaretrovirus dans le génome des rongeurs. En 2008, un ERV défectueux a été identifié du genre Gammaretrovirus chez les petites chauves-souris brunes.
L’adoption de la technologie HTS a conduit à la découverte de divers bêtarétrovirus et gammarétrovirus chez différentes espèces de chauves-souris. En 2020, la première détection confirmée de chauve-souris XRV, le gammaretrovirus pteropid Hervey (HPG), a eu lieu dans les excréments de renard volant noir. Les chercheurs ont également indiqué que les facteurs de restriction des chauves-souris jouent un rôle important dans l’établissement d’une relation entre les rétrovirus et les chauves-souris.
Rôle des chauves-souris dans la transmission interspécifique
La transmission interspécifique de rétrovirus entre différents mammifères est courante. Les rétrovirus de chauve-souris ne font donc pas exception. Les gamma et bêtarétrovirus, également appelés ERV de classe I et II, peuvent être transmis à d’autres espèces animales.
L’analyse de milliers d’ERV dans 69 génomes de mammifères indique que les rétrovirus de chauve-souris ont un rôle majeur en tant qu’hôtes de rétrovirus de mammifères. Étant le seul mammifère capable de voler, les chauves-souris jouent un rôle de plus en plus important dans la propagation des virus des mammifères. Les chauves-souris peuvent fournir une voie de transmission hypothétique parce que le vol leur permet de traverser des barrières physiques impénétrables pour les autres mammifères. Les chauves-souris sont également capables de parcourir de longues distances et peuvent traverser plusieurs zones biogéographiques.
Un tel exemple est le renard volant noir, l’hôte de HPG dont l’habitat s’étend à travers la frontière faunique océanique connue sous le nom de ligne Wallace. HPG est un proche parent du virus de la leucémie du singe gibbon (GALV) et du rétrovirus du koala (KoRV), dont les hôtes sont des koalas et des gibbons originaires d’Asie du Sud-Est et d’Australie et donc séparés par la lignée Wallace.
Les rétrovirus des chauves-souris sont-ils une menace pour l’homme ?
Les rétrovirus qui affectent les humains sont le VIH et le HTLV, bien que d’autres rétrovirus aient également infecté les ancêtres des humains. Les XVR de chauves-souris récents incluent les delta et gammaretrovirus. Le HTLV est un deltarétrovirus, alors que les gammarétrovirus ne sont pas connus pour infecter les humains.
Bien qu’aucune preuve d’infection n’ait été trouvée avec l’Eptesicus fuscus deltaretrovirus (EfDRV), ses proches parents HTLV et le virus de la leucémie bovine (BLV) ont le potentiel d’infecter les humains. Le BLV utilise le récepteur CAT1 pour pénétrer dans les cellules et s’est avéré se répliquer dans les cellules humaines in vitro, tandis que HTLV est un agent pathogène humain bien connu.
HPG est un proche parent de GALV et KoRV et, comme eux, utilise le récepteur PiT-1 pour entrer dans les cellules. HPG est capable d’infecter les cellules humaines in vitro ainsi que de libérer des particules virales dans la cellule. Cependant, cela ne garantit pas que le virus puisse provoquer une maladie chez l’homme.
La transmission interspécifique des rétrovirus peut se produire par diverses voies, telles que la contamination des aliments par l’urine, les fèces ou le sang. On peut ainsi conclure que la transmission des rétrovirus de la chauve-souris à l’homme nécessite le respect de diverses conditions et se fait le plus souvent via un hôte intermédiaire.
Conclusion
Ainsi, on peut conclure que la transmission de rétrovirus des chauves-souris à l’homme n’est pas encore très courante. Mais une surveillance continue des chauves-souris doit être effectuée pour identifier tout nouveau rétrovirus et enquêter sur ses propriétés biologiques et infectieuses, ce qui aidera à déterminer sa proactivité dans les retombées zoonotiques. Les défis actuels dans l’étude des chauves-souris et l’isolement des virus doivent être surmontés pour mieux comprendre les rétrovirus capables de se transmettre à l’homme et fournir des mesures préventives contre eux.