Un groupe de scientifiques a détecté du matériel génétique du SRAS-CoV-2 dans des échantillons d'eaux usées non traitées collectées en avril 2020 dans deux usines de traitement des eaux usées en Louisiane, aux États-Unis.
L'épidémiologie basée sur les eaux usées (WBE) est un processus par lequel la propagation de la maladie dans les populations humaines est suivie en analysant les eaux usées.
Il a été utilisé pour suivre la propagation de la polio et des infections à norovirus. De nombreux groupes à travers le monde travaillent sur le développement de méthodes pour adapter WBE au suivi du COVID-19. En utilisant ces méthodes, le SRAS-CoV-2 a été détecté dans les eaux usées municipales d'Australie, d'Espagne, d'Italie, des Pays-Bas et du Japon.
Dans un article publié dans la revue Science de l'environnement total, un groupe de chercheurs – dont Samendra P. Sherchan de l'Université de Tulane, aux États-Unis, et Masaaki Kitajima de l'Université d'Hokkaido – ont signalé la détection de l'ARN du SRAS-CoV-2 dans des échantillons d'eaux usées non traitées collectées en avril 2020 dans le sud de la Louisiane. Il s'agit du premier rapport de détection du virus dans les eaux usées en Amérique du Nord.
Des échantillons ont été collectés mensuellement entre janvier et avril 2020 dans deux usines de traitement des eaux usées anonymes, qui desservent respectivement des populations de 244 627 (STEP A) et 45 694 (STEP B).
Les échantillons comprenaient des eaux usées non traitées, des eaux usées traitées avant chloration et des effluents chlorés.
Les scientifiques ont tenté de récupérer le SRAS-CoV-2 à partir de ces échantillons par l'une des deux méthodes suivantes: ultrafiltration (filtrage des échantillons à travers des filtres extrêmement fins pour collecter le virus) ou élution par adsorption (passage de l'échantillon à travers une membrane qui lie le virus, puis collecte le virus en le rinçant).
La quantité de virus récupérée a été déterminée par transcription inverse-PCR quantitative, la méthode standard pour tester le SARS-CoV-2.
Sur un total de 15 échantillons, les scientifiques ont détecté le SRAS-CoV-2 dans seulement deux échantillons. Les virus ont été détectés dans des échantillons traités par ultrafiltration, mais pas dans les échantillons concentrés par adsorption-élution.
En outre, le virus n'a été détecté que dans les déchets non traités, mais dans aucun des échantillons d'eaux usées traitées – ce qui indique que le traitement standard des eaux usées peut être suffisant pour éliminer et / ou détruire le virus.
Enfin, le virus n'a été détecté que dans les échantillons collectés en avril (STEP A le 29 avril et STEP B le 8 avril). Au cours de la période d'échantillonnage, le nombre total de cas confirmés dans les zones desservies par les usines de traitement des eaux usées a été le plus élevé ce mois-ci.
Les scientifiques ont conclu que l'ultrafiltration était la meilleure méthode de récupération du virus, mais que d'autres facteurs peuvent interférer avec la détection du virus.
Cependant, d'autres tests sont nécessaires sur des échantillons de plus grande taille pour comprendre les limites de cette méthode et la comparer à d'autres méthodes actuellement testées dans le même but. En général, pour le WBE du COVID-19, de meilleures méthodes de concentration virale et de détection virale sont nécessaires.
Des rapports récents sur la détection de l'ARN du SRAS-CoV-2 dans plusieurs pays, dont le Japon et les États-Unis, ont validé le concept de WBE pour la surveillance du COVID-19. J'espère que les études COVID-19 WBE seront accélérées à l'échelle mondiale grâce à des collaborations internationales. «
Masaaki Kitajima, Université d'Hokkaido
Le professeur adjoint Kitajima est actuellement impliqué dans un certain nombre d'études liées à l'application de WBE pour suivre la propagation de la pandémie de COVID-19. Il a collaboré avec un certain nombre de scientifiques et de groupes de recherche à travers le monde dans cette entreprise et a fait partie de l'équipe qui a détecté pour la première fois le SRAS-CoV-2 dans les eaux usées au Japon.
La source:
Référence du journal:
Sherchan, S. P., et al. (2020) Première détection de l'ARN du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées en Amérique du Nord: une étude en Louisiane, États-Unis. Science de l'environnement total. doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140621.