La durée de vie du moustique Aedes aegypti varie de deux à quatre semaines en fonction des conditions environnementales, pendant lesquelles la femelle dépose environ mille œufs dans des conteneurs remplis d'eau à proximité des environnements humains, car elle a besoin de sang humain pour se reproduire et compléter son cycle de vie. Les moustiques mâles n'ont pas de système d'alimentation sanguine, donc seules les femelles sont en contact avec les humains, agissant comme vecteurs des virus Mayaro, Dengue, Chikunguya, fièvre jaune et Zika, ainsi que d'autres agents pathogènes. À ce jour, il n'existe aucune méthode totalement efficace pour éviter ce contact et la piqûre infectante de cette espèce.
Afin de déterminer les similitudes et les différences dans la prédisposition aux troubles intrinsèques des protéines exprimées par chacun de ces arbovirus et d'obtenir une «empreinte digitale» qui les identifie, un ensemble de programmes bioinformatiques développés par cette équipe de chercheurs a été appliqué pour récupérer l'indice de polarité Méthode® (PIM®) et les cartes de prédisposition aux troubles intrinsèques des protéines extraites de la base de données UniProt. Ces programmes ont été conçus en supposant que les séquences d'acides aminés contiennent des informations définissant la capacité d'une protéine donnée à se replier en une structure tridimensionnelle unique ou à rester intrinsèquement désordonnées et également à déterminer sa fonction prédominante.
Le PIM® Les profils et les cartes de prédisposition aux troubles intrinsèques ont été comparés à ceux générés pour d'autres groupes de protéines, tels que les bactéries, les champignons et les virus de la base de données UniProt, les peptides pénétrants cellulaires de la base de données CPP et deux groupes de protéines intrinsèquement désordonnées, totalement et partiellement désordonnées. Cette analyse comparative a caractérisé le groupe des arbovirus et l'a différencié des autres groupes de protéines en générant des «empreintes digitales» spécifiques qui les ont identifiées.
Les auteurs ont trouvé 1736 protéines parmi les 559 228 protéines « examinées » dans la base de données UniProt qui avaient un PIM similaire® profil aux 29 protéines mutées exprimées par les cinq groupes d'arbovirus. Les résultats suggèrent que le PIM® la caractérisation du profil pourrait être utile pour l'identification des protéines exprimées par les virus transmis par les arthropodes transmis par les moustiques Aedes aegypti.
La source:
Éditeurs scientifiques de Bentham
Référence de la revue:
Polanco, C., et al. (2020) Identification basée sur la bioinformatique des protéines exprimées par les virus transmis par les arthropodes transmis par Aedes Aegypti Mosquito. Protéomique actuelle. doi.org/10.2174/1570164617999200422123618.