Un nouveau test de diagnostic à faible coût pour la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) fournit rapidement des résultats précis sans avoir besoin d'un équipement sophistiqué, selon une étude publiée le 27 août 2020 dans le journal en libre accès Agents pathogènes PLOS par Teng Xu du Vision Medicals Center for Infectious Diseases, Tieying Hou de l'Académie des sciences médicales du Guangdong, Bing Gu de l'hôpital affilié de l'Université médicale de Xuzhou, Jianwei Wang de l'Académie chinoise des sciences médicales et du Peking Union Medical College, et collègues .
La demande croissante de dépistage et d'identification rapides du COVID-19 pose de grands défis diagnostiques. Le séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS) et la PCR à transcription inverse (RT-PCR) ont été les méthodes moléculaires les plus couramment utilisées pour diagnostiquer le COVID-19, mais chacune a ses propres limites. Par exemple, le séquençage est coûteux et a un délai d'exécution de près d'un jour, tandis que la RT-PCR nécessite un équipement spécialisé et est difficile à déployer à grande échelle. Un manque d'outils de diagnostic moléculaire rapides et précis a entravé les réponses efficaces de santé publique à la menace virale.
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont développé un test COVID-19 alternatif en tirant parti de la technologie CRISPR, qui a été largement utilisée ces dernières années pour l'édition de gènes. Le test, appelé CRISPR-COVID, permet une détection à haut débit du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) – le virus qui cause le COVID-19. CRISPR-COVID offre une sensibilité et une spécificité comparables à celles du mNGS en aussi peu que 40 minutes. Lorsqu'il est produit à grande échelle, le coût matériel d'un test CRISPR-COVID pourrait être inférieur à 70 cents, ce qui suggère que CRISPR-COVID est une alternative compétitive non seulement sur le plan technologique mais aussi financier.
Les auteurs notent: « Dans cette étude, nous avons développé un diagnostic isotherme basé sur CRISPR pour COVID-19 avec une sensibilité quasi-unique. » et « Nous avons démontré un test CRISPR pour COVID-19 qui offrait un temps de réponse plus court et une grande valeur diagnostique, même dans des environnements à faibles ressources sans avoir besoin de thermocycleurs. »
La source:
Référence du journal:
Hou, T., et coll. (2020) Développement et évaluation d'un diagnostic rapide basé sur CRISPR pour COVID-19. Pathogènes PLOS. doi.org/10.1371/journal.ppat.1008705.