La mise en quarantaine des individus potentiellement infectés est une approche largement utilisée pour contrôler la propagation des virus et autres agents pathogènes infectieux. Même dans le cas de la pandémie actuelle de coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le nouveau coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), une quarantaine de 14 jours a été recommandée par les Centers for Disease Control des États-Unis. et prévention (CDC) et l’Organisation mondiale de la santé (OMS). Ceci est basé sur notre compréhension actuelle de la période d’incubation du virus – le temps qu’il faut aux individus pré-symptomatiques pour montrer des signes d’infection.
Les experts se sont inquiétés du fait que cette période de quarantaine est très lourde et n’offre pas beaucoup d’avantages supplémentaires par rapport à des durées de quarantaine plus courtes qui pourraient augmenter la conformité en raison de la réduction des perturbations des activités quotidiennes.
Une stratégie fréquemment proposée pour raccourcir la durée de la quarantaine sans augmentation du risque consiste à utiliser un test RT-PCR ou un test rapide d’antigène pour «tester» la quarantaine. Récemment, le CDC a déclaré qu’il peut être acceptable parfois de mettre en quarantaine pendant 7 jours avec un test RT-PCR négatif en utilisant un échantillon prélevé dans les 48 heures suivant la sortie, ou même de mettre en quarantaine pendant 10 jours sans test. Cependant, les tests RT-PCR ne sont pas fiables à 100% et peuvent manquer des infections, surtout si quelqu’un est pré-symptomatique.
Estimation de la proportion d’infections non détectées par différentes méthodes de test pendant différentes durées de quarantaine
Dans un récent medRxiv* papier pré-imprimé, des chercheurs des universités Wake Forest et Johns Hopkins aux États-Unis ont discuté de leur tentative de quantifier la proportion d’infections qui ne sont pas détectées par différentes méthodes de test et durées de quarantaine. Les chercheurs ont calculé la probabilité que les individus infectés soient testés négatifs pour le SRAS-CoV-2 un jour donné après l’infection et restent sans symptômes pendant une période de temps.
Pour estimer ces probabilités, ils ont conçu un modèle biologiquement plausible en supposant que l’apparition des symptômes et la sensibilité du test sont indépendamment liées à un moment non observé après l’infection lorsque la charge virale franchit un seuil critique.
«Un test RT-PCR après les premiers jours de quarantaine diminue sensiblement la probabilité qu’une personne infectée ne soit pas détectée.»
Les personnes infectées ont 20,1% de chances de tester la RT-PCR négative le jour 5 après l’infection
Les résultats de l’étude ont montré que les personnes infectées ont 20,1% de chances (IC à 95% 9,8-32,6) de subir un test négatif à la RT-PCR le jour 5 après l’infection et de rester asymptomatiques jusqu’au jour 7. Ils ont également suggéré que les informations supplémentaires offertes par un test diminue à mesure qu’ils s’éloignent de la date du test.
Nous estimons qu’un individu infecté a 20,1% de chances (IC à 95% 9,8-32,6) de tester RT-PCR négatif le cinquième jour après l’infection et de rester asymptomatique jusqu’au septième jour, similaire à une quarantaine de 8 jours sans test.
Un test négatif à la RT-PCR ou à d’autres tests peut augmenter considérablement la confiance qu’un individu mis en quarantaine n’est pas infecté. Cependant, l’importance d’un test négatif diminue chaque jour qu’un individu passe après le test sans développer de symptômes. Ainsi, les auteurs ont conclu qu’un test moins sensible qui donne des résultats rapides pourrait être préférable à un test plus sensible avec des résultats retardés.
Selon les auteurs, l’importance des résultats des tests en temps opportun s’est également avérée critique dans d’autres contextes, et c’est la raison pour laquelle un test négatif le 5ème jour après l’infection offre peu d’avantages par rapport à 7 jours de quarantaine sans test.
Un test négatif peut augmenter considérablement la confiance qu’une personne en quarantaine n’est pas infectée, ce qui pourrait avoir un impact similaire à celui des quarantaines de 3 à 4 jours de plus. «
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / le comportement lié à la santé ou être traités comme des informations établies.